Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37973-201ENSMUST00000195767 1289 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Gm31135-202ENSMUST00000208946 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Gm35326-201ENSMUST00000218234 1041 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4803-201ENSMUST00000218729 1279 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
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Gtpbp6Q3U6U5 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
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Gtpbp6Q3U6U5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45263-201ENSMUST00000210377 1375 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm12327-201ENSMUST00000121729 1168 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 BB218582-201ENSMUST00000123623 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Gtpbp6Q3U6U5 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15403-201ENSMUST00000119343 1227 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Mup-ps10-201ENSMUST00000119626 556 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms