Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms