Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kdm4dQ3U2K5 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms