Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V1

Khsrp, Far upstream element-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KhsrpQ3U0V1 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KhsrpQ3U0V1 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KhsrpQ3U0V1 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KhsrpQ3U0V1 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KhsrpQ3U0V1 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KhsrpQ3U0V1 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KhsrpQ3U0V1 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KhsrpQ3U0V1 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KhsrpQ3U0V1 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KhsrpQ3U0V1 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KhsrpQ3U0V1 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KhsrpQ3U0V1 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KhsrpQ3U0V1 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KhsrpQ3U0V1 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KhsrpQ3U0V1 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KhsrpQ3U0V1 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KhsrpQ3U0V1 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KhsrpQ3U0V1 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KhsrpQ3U0V1 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KhsrpQ3U0V1 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KhsrpQ3U0V1 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
KhsrpQ3U0V1 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KhsrpQ3U0V1 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KhsrpQ3U0V1 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KhsrpQ3U0V1 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KhsrpQ3U0V1 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
KhsrpQ3U0V1 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KhsrpQ3U0V1 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KhsrpQ3U0V1 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KhsrpQ3U0V1 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
KhsrpQ3U0V1 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KhsrpQ3U0V1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KhsrpQ3U0V1 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KhsrpQ3U0V1 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KhsrpQ3U0V1 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KhsrpQ3U0V1 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KhsrpQ3U0V1 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KhsrpQ3U0V1 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KhsrpQ3U0V1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KhsrpQ3U0V1 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KhsrpQ3U0V1 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KhsrpQ3U0V1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KhsrpQ3U0V1 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KhsrpQ3U0V1 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KhsrpQ3U0V1 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KhsrpQ3U0V1 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KhsrpQ3U0V1 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KhsrpQ3U0V1 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KhsrpQ3U0V1 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
KhsrpQ3U0V1 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KhsrpQ3U0V1 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KhsrpQ3U0V1 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
KhsrpQ3U0V1 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KhsrpQ3U0V1 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KhsrpQ3U0V1 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KhsrpQ3U0V1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KhsrpQ3U0V1 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KhsrpQ3U0V1 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KhsrpQ3U0V1 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KhsrpQ3U0V1 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KhsrpQ3U0V1 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KhsrpQ3U0V1 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KhsrpQ3U0V1 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KhsrpQ3U0V1 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KhsrpQ3U0V1 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KhsrpQ3U0V1 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KhsrpQ3U0V1 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KhsrpQ3U0V1 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
KhsrpQ3U0V1 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KhsrpQ3U0V1 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KhsrpQ3U0V1 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KhsrpQ3U0V1 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KhsrpQ3U0V1 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KhsrpQ3U0V1 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
KhsrpQ3U0V1 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KhsrpQ3U0V1 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KhsrpQ3U0V1 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
KhsrpQ3U0V1 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
KhsrpQ3U0V1 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KhsrpQ3U0V1 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KhsrpQ3U0V1 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
KhsrpQ3U0V1 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KhsrpQ3U0V1 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KhsrpQ3U0V1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KhsrpQ3U0V1 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KhsrpQ3U0V1 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KhsrpQ3U0V1 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KhsrpQ3U0V1 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KhsrpQ3U0V1 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KhsrpQ3U0V1 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KhsrpQ3U0V1 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KhsrpQ3U0V1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KhsrpQ3U0V1 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KhsrpQ3U0V1 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KhsrpQ3U0V1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KhsrpQ3U0V1 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KhsrpQ3U0V1 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KhsrpQ3U0V1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KhsrpQ3U0V1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KhsrpQ3U0V1 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms