Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc9Q3U0M1 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms