Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0J8

Tbc1d2b, TBC1 domain family member 2B, mousemouse

Predictions only

Length 965 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2bQ3U0J8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Tbc1d2bQ3U0J8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Tbc1d2bQ3U0J8 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tbc1d2bQ3U0J8 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tbc1d2bQ3U0J8 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tbc1d2bQ3U0J8 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Tbc1d2bQ3U0J8 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Tbc1d2bQ3U0J8 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Tbc1d2bQ3U0J8 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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