Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms