Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms