Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms