Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms