Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms