Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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RubcnlQ3TD16 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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RubcnlQ3TD16 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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RubcnlQ3TD16 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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RubcnlQ3TD16 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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RubcnlQ3TD16 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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RubcnlQ3TD16 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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RubcnlQ3TD16 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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RubcnlQ3TD16 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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RubcnlQ3TD16 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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RubcnlQ3TD16 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RubcnlQ3TD16 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms