Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gbp8Q2V6D6 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbp8Q2V6D6 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms