Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna5Q2MKA5 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms