Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fam171bQ14CH0 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms