Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ptcd3Q14C51 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptcd3Q14C51 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
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