Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ptchd1Q14B62 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms