Protein–RNA interactions for Protein: Q14B02

Rnf133, E3 ubiquitin-protein ligase RNF133, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf133Q14B02 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rnf133Q14B02 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms