Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp2b3Q0VF55 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms