Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rundc1Q0VDN7 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms