Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vps8Q0P5W1 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms