Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms