Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Nf1Q04690 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Nf1Q04690 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Nf1Q04690 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Nf1Q04690 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Nf1Q04690 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Nf1Q04690 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Nf1Q04690 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Nf1Q04690 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Nf1Q04690 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Nf1Q04690 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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