Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg2Q03517 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms