Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Runx1Q03347 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms