Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NfiaQ02780 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NfiaQ02780 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NfiaQ02780 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NfiaQ02780 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NfiaQ02780 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NfiaQ02780 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NfiaQ02780 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NfiaQ02780 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NfiaQ02780 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NfiaQ02780 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NfiaQ02780 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NfiaQ02780 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NfiaQ02780 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NfiaQ02780 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NfiaQ02780 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NfiaQ02780 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NfiaQ02780 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NfiaQ02780 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NfiaQ02780 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NfiaQ02780 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NfiaQ02780 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NfiaQ02780 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NfiaQ02780 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NfiaQ02780 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NfiaQ02780 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NfiaQ02780 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NfiaQ02780 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NfiaQ02780 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NfiaQ02780 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NfiaQ02780 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NfiaQ02780 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NfiaQ02780 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NfiaQ02780 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NfiaQ02780 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NfiaQ02780 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NfiaQ02780 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NfiaQ02780 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NfiaQ02780 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NfiaQ02780 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NfiaQ02780 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NfiaQ02780 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NfiaQ02780 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NfiaQ02780 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NfiaQ02780 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NfiaQ02780 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NfiaQ02780 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NfiaQ02780 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NfiaQ02780 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NfiaQ02780 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NfiaQ02780 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NfiaQ02780 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NfiaQ02780 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NfiaQ02780 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NfiaQ02780 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NfiaQ02780 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NfiaQ02780 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NfiaQ02780 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NfiaQ02780 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NfiaQ02780 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NfiaQ02780 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NfiaQ02780 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NfiaQ02780 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NfiaQ02780 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.05■□□□□ 0
NfiaQ02780 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NfiaQ02780 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NfiaQ02780 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NfiaQ02780 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NfiaQ02780 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NfiaQ02780 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NfiaQ02780 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NfiaQ02780 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NfiaQ02780 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NfiaQ02780 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NfiaQ02780 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NfiaQ02780 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NfiaQ02780 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NfiaQ02780 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NfiaQ02780 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NfiaQ02780 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NfiaQ02780 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NfiaQ02780 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NfiaQ02780 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NfiaQ02780 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NfiaQ02780 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NfiaQ02780 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NfiaQ02780 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NfiaQ02780 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NfiaQ02780 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NfiaQ02780 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NfiaQ02780 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NfiaQ02780 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NfiaQ02780 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NfiaQ02780 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NfiaQ02780 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NfiaQ02780 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NfiaQ02780 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NfiaQ02780 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NfiaQ02780 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NfiaQ02780 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms