Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms