Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec23aQ01405 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms