Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EgfrQ01279 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms