Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms