Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms