Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Itga4Q00651 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms