Protein–RNA interactions for Protein: Q00175

Pgr, Progesterone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgrQ00175 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PgrQ00175 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PgrQ00175 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PgrQ00175 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PgrQ00175 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PgrQ00175 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PgrQ00175 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PgrQ00175 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PgrQ00175 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms