Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Bop1P97452 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Bop1P97452 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Bop1P97452 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Bop1P97452 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Bop1P97452 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Bop1P97452 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Bop1P97452 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Bop1P97452 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Bop1P97452 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
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