Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psme1P97371 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psme1P97371 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Psme1P97371 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psme1P97371 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psme1P97371 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psme1P97371 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psme1P97371 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Psme1P97371 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psme1P97371 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psme1P97371 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Psme1P97371 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psme1P97371 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Psme1P97371 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms