Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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