Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx1P80205 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx1P80205 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx1P80205 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx1P80205 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx1P80205 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx1P80205 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms