Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms