Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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