Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NficP70255 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NficP70255 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NficP70255 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NficP70255 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NficP70255 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NficP70255 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NficP70255 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NficP70255 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NficP70255 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NficP70255 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NficP70255 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NficP70255 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NficP70255 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NficP70255 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NficP70255 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NficP70255 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
NficP70255 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NficP70255 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NficP70255 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NficP70255 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
NficP70255 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NficP70255 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NficP70255 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NficP70255 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NficP70255 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NficP70255 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NficP70255 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NficP70255 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NficP70255 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NficP70255 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
NficP70255 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NficP70255 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NficP70255 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NficP70255 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NficP70255 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NficP70255 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NficP70255 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NficP70255 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NficP70255 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NficP70255 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NficP70255 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NficP70255 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NficP70255 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NficP70255 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NficP70255 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NficP70255 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NficP70255 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NficP70255 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NficP70255 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NficP70255 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NficP70255 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NficP70255 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NficP70255 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NficP70255 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NficP70255 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NficP70255 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NficP70255 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NficP70255 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NficP70255 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
NficP70255 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
NficP70255 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
NficP70255 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
NficP70255 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
NficP70255 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
NficP70255 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NficP70255 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NficP70255 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NficP70255 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NficP70255 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NficP70255 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NficP70255 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NficP70255 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NficP70255 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NficP70255 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NficP70255 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NficP70255 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NficP70255 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NficP70255 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NficP70255 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NficP70255 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NficP70255 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NficP70255 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NficP70255 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NficP70255 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NficP70255 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NficP70255 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NficP70255 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NficP70255 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NficP70255 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NficP70255 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NficP70255 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NficP70255 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NficP70255 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NficP70255 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NficP70255 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NficP70255 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NficP70255 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NficP70255 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NficP70255 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms