Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SbdsP70122 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SbdsP70122 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SbdsP70122 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SbdsP70122 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SbdsP70122 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SbdsP70122 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SbdsP70122 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SbdsP70122 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SbdsP70122 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SbdsP70122 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SbdsP70122 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SbdsP70122 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SbdsP70122 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SbdsP70122 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SbdsP70122 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SbdsP70122 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SbdsP70122 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SbdsP70122 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SbdsP70122 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SbdsP70122 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SbdsP70122 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SbdsP70122 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SbdsP70122 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SbdsP70122 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SbdsP70122 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SbdsP70122 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SbdsP70122 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SbdsP70122 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SbdsP70122 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SbdsP70122 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SbdsP70122 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SbdsP70122 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SbdsP70122 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SbdsP70122 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SbdsP70122 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SbdsP70122 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SbdsP70122 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SbdsP70122 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SbdsP70122 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SbdsP70122 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SbdsP70122 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SbdsP70122 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SbdsP70122 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SbdsP70122 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SbdsP70122 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SbdsP70122 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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