Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rps11P62281 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rps11P62281 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rps11P62281 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rps11P62281 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rps11P62281 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rps11P62281 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms