Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PlnP61014 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PlnP61014 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PlnP61014 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PlnP61014 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PlnP61014 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PlnP61014 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PlnP61014 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PlnP61014 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PlnP61014 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PlnP61014 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PlnP61014 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PlnP61014 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PlnP61014 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PlnP61014 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PlnP61014 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PlnP61014 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PlnP61014 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PlnP61014 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PlnP61014 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PlnP61014 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PlnP61014 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PlnP61014 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PlnP61014 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PlnP61014 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PlnP61014 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PlnP61014 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PlnP61014 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PlnP61014 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PlnP61014 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PlnP61014 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PlnP61014 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PlnP61014 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PlnP61014 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PlnP61014 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PlnP61014 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PlnP61014 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PlnP61014 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PlnP61014 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PlnP61014 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PlnP61014 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PlnP61014 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PlnP61014 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PlnP61014 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PlnP61014 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PlnP61014 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PlnP61014 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PlnP61014 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PlnP61014 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PlnP61014 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PlnP61014 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PlnP61014 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PlnP61014 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PlnP61014 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PlnP61014 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PlnP61014 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
PlnP61014 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PlnP61014 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PlnP61014 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PlnP61014 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PlnP61014 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PlnP61014 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PlnP61014 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PlnP61014 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
PlnP61014 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
PlnP61014 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
PlnP61014 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PlnP61014 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PlnP61014 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PlnP61014 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PlnP61014 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PlnP61014 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PlnP61014 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PlnP61014 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PlnP61014 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PlnP61014 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PlnP61014 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PlnP61014 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PlnP61014 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PlnP61014 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PlnP61014 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PlnP61014 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PlnP61014 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PlnP61014 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PlnP61014 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PlnP61014 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PlnP61014 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PlnP61014 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PlnP61014 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PlnP61014 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PlnP61014 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PlnP61014 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PlnP61014 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
PlnP61014 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PlnP61014 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PlnP61014 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PlnP61014 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PlnP61014 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PlnP61014 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PlnP61014 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms