Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snap25P60879 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snap25P60879 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snap25P60879 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snap25P60879 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms