Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ctdsp1P58466 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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