Protein–RNA interactions for Protein: P56371

Rab4a, Ras-related protein Rab-4A, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4aP56371 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Rab4aP56371 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Rab4aP56371 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab4aP56371 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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