Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcnfP51944 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnfP51944 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnfP51944 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnfP51944 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnfP51944 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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CcnfP51944 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnfP51944 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnfP51944 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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