Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TspoP50637 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TspoP50637 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TspoP50637 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TspoP50637 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TspoP50637 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TspoP50637 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TspoP50637 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TspoP50637 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TspoP50637 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TspoP50637 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TspoP50637 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TspoP50637 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TspoP50637 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TspoP50637 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TspoP50637 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TspoP50637 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TspoP50637 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TspoP50637 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TspoP50637 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TspoP50637 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
TspoP50637 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TspoP50637 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TspoP50637 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TspoP50637 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
TspoP50637 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TspoP50637 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TspoP50637 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TspoP50637 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TspoP50637 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TspoP50637 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TspoP50637 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TspoP50637 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TspoP50637 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TspoP50637 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TspoP50637 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TspoP50637 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TspoP50637 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TspoP50637 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TspoP50637 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TspoP50637 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TspoP50637 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TspoP50637 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TspoP50637 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TspoP50637 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TspoP50637 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TspoP50637 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TspoP50637 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TspoP50637 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TspoP50637 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TspoP50637 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TspoP50637 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TspoP50637 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TspoP50637 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TspoP50637 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TspoP50637 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TspoP50637 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TspoP50637 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TspoP50637 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TspoP50637 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TspoP50637 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TspoP50637 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TspoP50637 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TspoP50637 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TspoP50637 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TspoP50637 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TspoP50637 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TspoP50637 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TspoP50637 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TspoP50637 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TspoP50637 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TspoP50637 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TspoP50637 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TspoP50637 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TspoP50637 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TspoP50637 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TspoP50637 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TspoP50637 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TspoP50637 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TspoP50637 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TspoP50637 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TspoP50637 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TspoP50637 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TspoP50637 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TspoP50637 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TspoP50637 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TspoP50637 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TspoP50637 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TspoP50637 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TspoP50637 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TspoP50637 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TspoP50637 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TspoP50637 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TspoP50637 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TspoP50637 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TspoP50637 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TspoP50637 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TspoP50637 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TspoP50637 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TspoP50637 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms