Protein–RNA interactions for Protein: P49935

Ctsh, Pro-cathepsin H, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtshP49935 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CtshP49935 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtshP49935 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtshP49935 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CtshP49935 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtshP49935 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtshP49935 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtshP49935 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CtshP49935 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtshP49935 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtshP49935 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CtshP49935 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtshP49935 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtshP49935 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtshP49935 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CtshP49935 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtshP49935 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtshP49935 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtshP49935 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtshP49935 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtshP49935 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtshP49935 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtshP49935 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtshP49935 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtshP49935 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtshP49935 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtshP49935 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtshP49935 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtshP49935 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CtshP49935 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtshP49935 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtshP49935 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtshP49935 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtshP49935 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtshP49935 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtshP49935 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtshP49935 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtshP49935 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtshP49935 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtshP49935 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtshP49935 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtshP49935 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CtshP49935 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtshP49935 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtshP49935 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtshP49935 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtshP49935 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtshP49935 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtshP49935 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtshP49935 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtshP49935 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtshP49935 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtshP49935 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtshP49935 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtshP49935 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtshP49935 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtshP49935 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtshP49935 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtshP49935 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtshP49935 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtshP49935 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtshP49935 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtshP49935 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtshP49935 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CtshP49935 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtshP49935 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtshP49935 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtshP49935 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtshP49935 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtshP49935 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CtshP49935 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CtshP49935 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtshP49935 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtshP49935 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtshP49935 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtshP49935 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtshP49935 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtshP49935 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtshP49935 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtshP49935 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtshP49935 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtshP49935 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtshP49935 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtshP49935 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtshP49935 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtshP49935 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtshP49935 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtshP49935 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtshP49935 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtshP49935 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtshP49935 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtshP49935 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtshP49935 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtshP49935 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtshP49935 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtshP49935 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtshP49935 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CtshP49935 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtshP49935 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CtshP49935 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms