Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms